मनसे अध्यक्ष राज ठाकरे (Raj Thackeray) यांच्या हत्येचा कट शिवसैनिकांच्या माध्यमातून रचण्यात आला होता. मुंबईच्या काही गुंडांना सुपारी देण्यात आली. राज यांच्या 2005 च्या मालवण दौऱ्यात त्यांना मार्गावरून हटवण्याची योजना होती. शिवसेनेपासून वेगळे झालेल्या नारायण राणेंवर (Narayan Rane) खुनाचा संशय येईल आणि शिवसेनेऐवजी नारायण राणे संशयाच्या भोवऱ्यात येतील, असे वाटले होते. उद्धव ठाकरे (Uddhav Thackeray) यांचे नाव न घेता, असा गंभीर आरोप मनसेचे प्रवक्ते संदीप देशपांडे (Sandeep Deshpande) यांनी त्यांच्याकडे लक्ष वेधताना केला आहे. त्यावेळी केंद्रीय मंत्री नारायण राणे शिवसेनेपासून फारकत घेतल्याचे संदीप देशपांडे म्हणाले.
त्यांच्या कार्यकाळात मालवणला जाण्याची हिंमत शिवसेनेतील कोणाची नव्हती. मालवणातच राज ठाकरेंना उडवण्याचा कट रचला गेला आणि नारायण राणेंना या प्रकरणात गोवण्याचा कट रचला गेला. हे षडयंत्र का रचले गेले? याला उत्तर देताना संदीप देशपांडे म्हणतात की, राज ठाकरे हे त्यांच्याच पक्षात मोठे स्पर्धक होते. स्पर्धक म्हणून काटेरी काटे काढण्यासाठी नीच राजकारण खेळले जात होते. हेही वाचा Narayan Rane On Ajit Pawar: अजित पवारांना नारायण राणेंचे प्रत्यूत्तर, म्हणाले - पुण्यात येऊन बारा वाजवू
संदीप देशपांडे म्हणाले, 'जेव्हा राज ठाकरे 1988 मध्ये भारतीय विद्यार्थी सेना चालवत होते. उद्धव ठाकरे फक्त फोटोग्राफी करायचे. जाहिरात एजन्सी चालवत होता. 1995 मध्ये राज ठाकरेंनी 80 सभा घेतल्या. ते सलग तीन महिने राजसभा सांभाळत होते.1995 मध्ये भाजप आणि शिवसेनेची सत्ता आल्यावर उद्धव ठाकरेंना मुख्यमंत्री होण्याची स्वप्ने पडू लागली.
हा मुद्दा पुढे नेत संदीप देशपांडे म्हणतात, 'राज ठाकरेंकडे बाळासाहेब ठाकरेंनंतर पुढचे नेते म्हणून पाहिले जात होते, तेव्हा 1995 ते 2000 या काळात त्यांच्याविरोधात कट रचण्याचा काळ सुरू झाला. 2000 मध्ये उद्धव ठाकरे यांची प्रकृती ढासळू लागली. 2002 मध्ये बाळासाहेब ठाकरे यांची इच्छा पूर्ण करण्यासाठी राज ठाकरेंनी पदत्याग केला आणि उद्धव ठाकरे यांची कार्याध्यक्ष म्हणून नियुक्ती केली.